Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BccipQ9CWI3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms