Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms