Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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