Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PsenenQ9CQR7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PsenenQ9CQR7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms