Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms