Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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