Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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