Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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