Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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