Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac9Q99N13 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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