Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ms4a4dQ99N05 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ms4a4dQ99N05 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms