Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms