Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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