Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdpd3Q99LY2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms