Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms