Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sh3bp5lQ99LH9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms