Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms