Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ciao1Q99KN2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms