Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms