Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LsrQ99KG5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LsrQ99KG5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms