Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlgn1Q99K10 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms