Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms