Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms