Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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