Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clip1Q922J3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms