Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms