Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms