Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms