Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnajc28Q8VCE1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnajc28Q8VCE1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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