Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpap2Q8VC34 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms