Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApobrQ8VBT6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms