Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms