Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vmn1r200Q8R281 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vmn1r200Q8R281 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vmn1r200Q8R281 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vmn1r200Q8R281 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vmn1r200Q8R281 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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