Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Colec12Q8K4Q8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Colec12Q8K4Q8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Colec12Q8K4Q8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Colec12Q8K4Q8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms