Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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