Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud6bQ8K2H2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud6bQ8K2H2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud6bQ8K2H2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud6bQ8K2H2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud6bQ8K2H2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms