Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms