Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc4a8Q8JZR6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms