Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Upp2Q8CGR7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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