Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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