Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ercc8Q8CFD5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms