Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms