Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Lrrc9Q8CDN9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Lrrc9Q8CDN9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Lrrc9Q8CDN9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Lrrc9Q8CDN9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc9Q8CDN9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc9Q8CDN9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms