Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Bcas3Q8CCN5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Bcas3Q8CCN5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Bcas3Q8CCN5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Bcas3Q8CCN5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Bcas3Q8CCN5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Bcas3Q8CCN5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bcas3Q8CCN5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bcas3Q8CCN5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bcas3Q8CCN5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bcas3Q8CCN5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Bcas3Q8CCN5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bcas3Q8CCN5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bcas3Q8CCN5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bcas3Q8CCN5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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