Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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