Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg4aQ8C9S8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Atg4aQ8C9S8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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