Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubqln3Q8C5U9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ubqln3Q8C5U9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms