Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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