Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik4Q8BMF5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik4Q8BMF5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms