Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smarcal1Q8BJL0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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